為了加強畜禽養殖場(小區)、戶的管理，規范畜禽養殖行為，把好養殖產品質量安全關，湖北省各級畜牧獸醫部門對畜禽規模養殖場(小區)、戶和種畜、奶牛養殖場(小區)、戶建立養殖檔案。
湖北畜牧局和十堰市、荊州市等6個市州，以及丹江口等9個縣市區設立了畜產品安全監督機構；天門市、宜昌市夷陵區等40個市縣明確了畜產品質量安全監管部門。部、省、市、縣四級檢測機構相繼建立，部分市州已開展檢測工作，變被動監管為主動檢測，使監管手段不斷完善。既有專項整治又有例行檢查，既有拉網式抽查又有快速檢測。從2010年～2011年全省就快速抽檢豬尿、豬肝25萬批次以上，合格率在98%以上；農業部多次對武漢、宜昌、黃岡等地進行的例行監測和拉網式突擊檢測，湖北抽檢合格率都達到100%。
從2003年開展認證工作以來，湖北省累計認證無公害畜產品739個，認定無公害畜產品產地793個，綠色食品134個，全省“三品”認證產品占畜產品總量30%以上。2010年，鄖西馬頭山羊獲國家農產品地理標志認證，京山華源王漿和蜂蜜、神農架康俊蜂蜜獲有機食品認證。2011年，全省通過無公害產地認證131個、產品認證137個。截至目前，湖北省畜牧產業共有麻城黑山羊、馬頭山羊、當陽雙蓮雞等6個地理標志、華源王漿(蜂蜜)等5個有機畜禽產品、千秀谷土雞等5個綠色食品、明祥生豬等616個無公害畜產品，約占認證農產品總量的30%。
