病毒的復制和繁殖是在寄生宿主細胞內完成，病毒容易發生變異，故用合成的化學藥物殺滅病毒作用及疫苗的防治作用都很有限，因此，西藥抗病毒藥物在獸醫臨床上的應用越來越嚴格。眾所周知，中草藥具有良好的抗病毒作用，可以直接殺死病毒，但對動物機體無損害，并且可以調節免疫功能，增強動物的抗病的能力，具有良好的臨床應用前景。但是使用過程中應注意防止不良反應的發生才能更好地發揮中草藥的治療作用。中草藥是民族醫藥的重要瑰寶，在臨床上具有良好的應用前景，研究其作用機理和治療具有重要意義，因此，廣大獸醫工作者應加大中草藥的研究力度，推進中醫中草藥的發展。
抗病毒
許多單劑的中草藥可以直接殺滅病毒，或者阻止病毒吸附、穿入、復制等環節，防止病毒復制繁殖，從而起到抗病毒的作用。常用的醋、黃芪、板藍根、蒲公英、甘草、三七、大黃、大青葉、麻黃、蒼術、桑葉、連翹、穿心蓮、柴胡、菊花、黃連等清熱解毒藥物都有殺滅病毒的作用。將中草藥成分提取或合成制成制劑可應用于直接抗病毒的治療如大黃醇的提取液可以直接殺滅病毒；甘草根提取的活性成分甘草甜素也對帶狀皰疹病毒有殺滅作用；中草藥活性成分黃酮類、多糖及其衍生物等可通過阻止病毒吸附和穿入宿主細胞發揮抗病毒作用；多酚類物質可抑制病毒蛋白質和RNA的合成，阻止病毒復制，達到抗病毒的目的；板藍根與黃芪合用，可以抑制呼吸綜合征病毒的自我復制過程，抑制病毒的增殖。
間接抗病毒
有研究證明，現今有200余種補益類、清熱解毒類、滲濕利水類以及少數解表、固澀、驅蟲類等中草藥具有調節動物機體的主動和被動免疫機制的功能。調節被動免疫功能主要通過提高動物的機體非特異性免疫力、增強胸腺、淋巴等免疫器官的功能、增強淋巴結、脾臟、骨髓等器官中存在的免疫細胞的吞噬功能，增強自然殺傷細胞的活性，并能誘生天然的非特異免疫防御因子干擾素，提高動物機體的體液和細胞免疫功能，起到抗病毒作用。中草藥對主動免疫的調節主要通過調節：（1）丘腦-垂體-腎上腺皮質內分泌系統；
（2）神經-體液調節系統；（3）調整植物性神經的功能；（4）調節環核苷酸系統的功能，影響核酸的代謝來增強免疫機能；（5）增加T淋巴細胞的數量和質量。如金銀花、板藍根、黃連等中草藥能增強吞噬細胞的吞噬能力；魚腥草、穿心蓮、野菊花、丹皮、大黃等可以提高白細胞的吞噬功能：刺五加、甘草、靈芝、茯苓、丹參等可增強單核細胞的免疫作用；香菇提取物香菇素，可以誘導產生血清IFN；甘草提取液甘草甜素可以誘導II型IFN的產生。
常用抗病毒中草藥——黃芪
黃芪是常用的抗病毒藥物，可以影響病毒的核酸代謝，阻斷核酸合成，阻止病毒的復制和繁殖，直接殺滅或抑制病毒；增強免疫系統功能，促進抗體的產生，增強巨噬細胞的吞噬作用，間接消滅病毒；誘導機體干擾素的產生，提高抗病能力。并且其起效快，作用效果持久，被廣泛應用于畜牧養殖的抗病防病中。
常用抗病毒中草藥——連翹
連翹是常用的清熱解毒藥，具有廣泛的抗病毒作用，其提取物金絲桃素對禽流感病毒的H5 N1、H9N2型以及新城疫病毒、支氣管炎病毒、法氏囊病毒、鴨肝炎病毒等RNA病毒都具有明顯的殺滅作用，應用前景良好。
常用抗病毒中草藥——野菊花
野菊花是常用的抗菌抗病毒藥物，其抗流感病毒作用較強，能抑制流感病毒的活性，可用于流感的預防。
常用抗病毒復方合劑——雙黃連合劑
雙黃連合劑由金銀花、連翹、黃芩合成，抗病毒作用較強，對流行性腹瀉、豬繁殖與呼吸綜合征及麻疹具有良好的治療作用。
常用抗病毒復方合劑——抗病毒顆粒沖劑
由金銀花、連翹、大青葉、板藍根、杏仁、黃芩等多味中草藥合成，具有明顯的抗病毒消炎作用，對雞混合感染雞副嗜血桿菌和傳染性支氣管炎病毒具有良好的治療效果。多用于呼吸道傳染病的治療。
常用抗病毒復方合劑——清熱解毒口服液
其主要成分是金銀花、黃芩、地黃等，能抑制多種病毒和細菌的復制和繁殖，增強機體的免疫能力，可用于流感、病毒性肺炎的防治。
抗病毒中草藥的不良反應
中草藥發生不良反應比西藥少，但是由于技術限制，在提純中草藥提取物提純、合成復方制劑及制成針劑粉劑過程中常出現引起機體不良反應的物質，另外由于部分中草藥也具有毒性作用，因此，中草藥使用過程中還應注意其不良反應。如雙黃連的粉劑和注射液常引起變態反應，主要表現為過敏性休克；呼吸困難、喉頭水腫等呼吸系統反應；嘔吐腹瀉等消化系統反應。
